En tant qu’Organisme à Vocation Sanitaire (OVS), FREDON a pour rôle d’accompagner les gestionnaires de santé, les gestionnaires de milieu, ainsi que toute structure ayant comme objectif la réduction de l’impact de différents organismes végétaux et animaux causant des troubles sanitaires et environnementaux.
De nombreuses espèces animales ou végétales peuvent causer de graves problèmes de santé chez l'Homme. C'est le cas de l'ambroisie, espèce végétale invasive fortement allergisante, ou des chenilles urticantes. Certains rongeurs (aquatiques ou champêtres) comme les ragondins ou les campagnols terrestres sont, eux, vecteurs de maladies et de parasites.