Créé en 1983 et modifié par la loi de finances de 2008, le Crédit d’Impôt Recherche (CIR) a pour objectif d’améliorer l’innovation et la compétitivité des entreprises. Il permet aux entreprises des secteurs industriel, agricole ou commercial de baisser le montant de leur investissement en Recherche et Développement grâce à une réduction d'impôt (30% des dépenses en recherche et développement, dans la limite de 100 millions d'euros, et de 5% lorsque les sommes dépassent ce seuil). Lorsqu’elles font appel à un sous-traitant pour mener des projets de Recherche et Développement, les entreprises peuvent inclure le montant des frais sous-traités dans l'assiette du CIR, si le prestataire a obtenu l'agrément CIR.

Dans ce contexte, et afin de répondre à la demande de ses clients (notamment en expérimentation), FREDON Hauts-de-France figure dans la liste des organismes de recherche agréés au titre du CIR publiée sur le site du Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l’Innovation (MESRI), depuis 2017. Cet agrément étant valable pour une durée de 3 ans, un renouvellement a été sollicité, fin 2022, sur base d’un projet de recherche innovant (Recherche de méthodes alternatives contre le doryphore) et obtenu début 2023, pour la période 2023-2025.